微型蠕動泵短期停用時，檢查泵的管路有無過于磨損的現象，用手轉動泵輪，查看整體的靈活性。如果軸承出現干磨現象，可向軸承體內加入軸承潤滑機油，觀察油位應在油標的中心線處，潤滑油應及時更換或補充。查看蠕動泵泵頭上的擰緊螺栓，是否擰緊。

長期停用時，需將泵全部拆開，擦干水分，將轉動部位及結合處涂以油脂裝好，妥善保存。泵在冬天使用完時，需將泵體下部放水螺塞擰開將介質放凈。防止凍裂。買泵的時候，在選擇流量范圍的時候，不要照著太靠前或靠后的值去選擇，應取中間值。

在運行期間，控制流量和揚程在標牌上注明的范圍內，以保證微型蠕動泵在較高的效率點運轉，才能獲得不錯的節能效果。泵軸的溫度不要超過80度，否則會影響泵的使用。運行期間，有異響應停泵檢查，不得強行運轉。當蠕動泵不工作時，應松開壓力塊，以延長泵管的使用壽命。

微型蠕動泵通過壓縮軟管和軟管的自然回彈產生吸力和流體輸送。為了保持泵管的長壽命，在不使用泵時，盡量提起泵頭塊，使泵管處于自然不受壓力的狀態，從而延長泵管的使用壽命。在滿足流量的前提下，盡量將泵速降低到300轉以內。蠕動泵的流量是由泵頭旋轉產生的。如果旋轉越快，泵管的使用時間就越短。

因此當泵管使用時間較長時，可以能選擇管徑較大的泵，以降低泵的速度。泵頭采用蠕動泵管，其余連接管可采用普通管。由于蠕動泵上使用的擠壓管具有良好的抗壓彈性和撕裂性，這些泵管的材料純度相對較高，幾何尺寸精度較高，導致蠕動泵管價格較高。

蠕動泵管的入口應盡可能短，管道的接頭和直徑不得低于泵頭安裝的卡管的直徑。微型蠕動泵的吸力是由泵管的反彈引起的。如果管道，特別是入口管路過長或直徑較小，則吸入端阻力過大，泵管反彈阻力過大，實際輸送流量損失。同樣如果出口管路的直徑較小或過長，由于蠕動泵的排放壓力通常較小，當排放阻力過大時，輸出流量會降低。