微型蠕動泵的初始投資成本可能略高于其他正排量泵，但其他泵的相關輔助設備、安裝、維護和備件成本可能非常大，就生命周期成本而言，微型蠕動泵更勝一籌。在微型蠕動泵中，管子或軟管是濕部件，幾乎無需維護，也沒有需要替換的昂貴的密封，沒有會發生堵塞的止回閥，也沒有會發生磨損的轉子或定子。

當然，軟管或管子需要定期更換。即便如此，在軟管疲勞失效前，微型蠕動泵可實現數千小時的可靠運轉。而更換軟管的過程花費的時間還不到1小時，某些情況下只需要幾分鐘。此外無需任何特殊工具，軟管就可以快速安全的換好。

這比隔膜泵或單螺桿泵所需的4-6小時的修復時間要少得多，這還不包括它們在移動、轉移和重新安裝時所占用的額外時間。相比隔膜泵或單螺桿泵的修復，軟管的成本是非常低的，后者的濕端替換部件(例如球閥、轉子和定子)可以占到泵的初始采購成本的75%。

微型蠕動泵不需要安裝輔助設備。隔膜泵需要背壓閥和排氣閥來保內部止回閥的正確運轉。單螺桿泵通常需要雙機械密封、沖洗系統、干運轉保護和內置止回閥。而使用蠕動泵，這些輔助元件的成本都可以免除了。

工藝控制的需要和化學相容性，通常使蠕動泵的成本低于其他正排量泵。例如當單螺桿泵只能采用昂貴的金屬，來達到耐腐蝕性要求時，其價格可能會呈指數增長。許多正排量泵需要額外購買獨立的控制板或變頻器，以實現可變的流量計量。如果需要增大流量范圍，成本和復雜性也會增加。

但是蠕動泵本身就具有高流量范圍、閉環轉速控制能力以及可連接到DCS，SCADA和PROFIBUS系統的可擴展I/O接口。蠕動泵具備自吸功能，這提高了操作人員的安全性，因為減少了危險化學品的處理過程。

這種泵還具有一定的干運轉功能，非常適用于儲罐的排空或其他無人操作場合。蠕動泵還可以反運轉，只須改變轉動方向就可以用來排干管道或排除管道堵塞。